Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX11Q9Y5W9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX11Q9Y5W9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX11Q9Y5W9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX11Q9Y5W9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX11Q9Y5W9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX11Q9Y5W9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX11Q9Y5W9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX11Q9Y5W9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX11Q9Y5W9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX11Q9Y5W9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX11Q9Y5W9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX11Q9Y5W9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX11Q9Y5W9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX11Q9Y5W9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SNX11Q9Y5W9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SNX11Q9Y5W9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX11Q9Y5W9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX11Q9Y5W9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX11Q9Y5W9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX11Q9Y5W9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX11Q9Y5W9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX11Q9Y5W9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX11Q9Y5W9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX11Q9Y5W9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms