Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC1Q9Y5R8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms