Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMED7Q9Y3B3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms