Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHDC2Q9Y2U9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHDC2Q9Y2U9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms