Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
YBX2Q9Y2T7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms