Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIKFYVEQ9Y2I7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIKFYVEQ9Y2I7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms