Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GNEQ9Y223 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNEQ9Y223 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms