Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HDAC5Q9UQL6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HDAC5Q9UQL6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms