Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPS5Q9UPZ3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HPS5Q9UPZ3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms