Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNOT6Q9ULM6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNOT6Q9ULM6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms