Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PALD1Q9ULE6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PALD1Q9ULE6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms