Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
ZNF608Q9ULD9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ZNF608Q9ULD9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms