Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH7Q9ULB5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDH7Q9ULB5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDH7Q9ULB5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms