Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAPPC2LQ9UL33 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms