Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC13A4Q9UKG4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC13A4Q9UKG4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms