Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF2IRD1Q9UHL9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms