Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBF1Q9UH73 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EBF1Q9UH73 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms