Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIP2Q9UDT6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CLIP2Q9UDT6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms