Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HDAC6Q9UBN7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC6Q9UBN7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms