Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL42Q9P2K6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL42Q9P2K6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms