Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC88CQ9P219 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC88CQ9P219 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC88CQ9P219 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC88CQ9P219 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC88CQ9P219 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC88CQ9P219 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC88CQ9P219 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC88CQ9P219 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC88CQ9P219 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC88CQ9P219 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC88CQ9P219 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC88CQ9P219 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC88CQ9P219 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms