Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.89■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC44.89■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.89■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC44.89■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC44.89■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC44.89■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC44.88■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC44.88■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC44.88■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC44.88■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.88■■■■■ 4.78
CCDC180Q9P1Z9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC44.87■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC44.87■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC44.86■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC44.86■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC44.86■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC44.85■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC44.85■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.85■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC44.84■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC44.83■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC44.83■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC44.83■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC44.83■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.82■■■■■ 4.77
CCDC180Q9P1Z9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.81■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC44.81■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.8■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.78■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC44.76■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC44.76■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC44.76■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC44.76■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC44.76■■■■■ 4.76
CCDC180Q9P1Z9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC44.75■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC44.75■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC44.75■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC44.75■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC44.75■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.74■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC44.73■■■■■ 4.75
CCDC180Q9P1Z9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms