Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNRD1Q9P1U0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNRD1Q9P1U0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms