Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SENP1Q9P0U3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SENP1Q9P0U3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms