Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTEL1Q9NZ71 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RTEL1Q9NZ71 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms