Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMOD3Q9NYL9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMOD3Q9NYL9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD3Q9NYL9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms