Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COA4Q9NYJ1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COA4Q9NYJ1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COA4Q9NYJ1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COA4Q9NYJ1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COA4Q9NYJ1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COA4Q9NYJ1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COA4Q9NYJ1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COA4Q9NYJ1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COA4Q9NYJ1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COA4Q9NYJ1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COA4Q9NYJ1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COA4Q9NYJ1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COA4Q9NYJ1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COA4Q9NYJ1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COA4Q9NYJ1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COA4Q9NYJ1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COA4Q9NYJ1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COA4Q9NYJ1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COA4Q9NYJ1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COA4Q9NYJ1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COA4Q9NYJ1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COA4Q9NYJ1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COA4Q9NYJ1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms