Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSD3Q9NYI0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSD3Q9NYI0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms