Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHL28Q9NXS3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL28Q9NXS3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms