Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM260Q9NX78 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM260Q9NX78 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms