Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR3EQ9NVU0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR3EQ9NVU0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms