Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ASF1BQ9NVP2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ASF1BQ9NVP2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms