Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE7

PANK4, Pantothenate kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK4Q9NVE7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PANK4Q9NVE7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PANK4Q9NVE7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PANK4Q9NVE7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PANK4Q9NVE7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PANK4Q9NVE7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PANK4Q9NVE7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PANK4Q9NVE7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PANK4Q9NVE7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PANK4Q9NVE7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PANK4Q9NVE7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PANK4Q9NVE7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms