Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM140Q9NV12 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM140Q9NV12 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms