Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP8A2Q9NTI2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP8A2Q9NTI2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP8A2Q9NTI2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP8A2Q9NTI2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8A2Q9NTI2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8A2Q9NTI2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8A2Q9NTI2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8A2Q9NTI2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8A2Q9NTI2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8A2Q9NTI2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8A2Q9NTI2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP8A2Q9NTI2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP8A2Q9NTI2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP8A2Q9NTI2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP8A2Q9NTI2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP8A2Q9NTI2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP8A2Q9NTI2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP8A2Q9NTI2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP8A2Q9NTI2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP8A2Q9NTI2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP8A2Q9NTI2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP8A2Q9NTI2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP8A2Q9NTI2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP8A2Q9NTI2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP8A2Q9NTI2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP8A2Q9NTI2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms