Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCND1Q9NSA2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCND1Q9NSA2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms