Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VPS45Q9NRW7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms