Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX15Q9NRS6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms