Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DUOX2Q9NRD8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DUOX2Q9NRD8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
DUOX2Q9NRD8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms