Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRHQ9HD43 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRHQ9HD43 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms