Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LGR6Q9HBX8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LGR6Q9HBX8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms