Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MED28Q9H204 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MED28Q9H204 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms