Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMG9Q9H0W8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG9Q9H0W8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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