Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC8Q9H0W5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC8Q9H0W5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC8Q9H0W5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms