Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LSG1Q9H089 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LSG1Q9H089 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms