Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM6Q9C030 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM6Q9C030 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.5 ms