Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM6SF1Q9BZW5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM6SF1Q9BZW5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM6SF1Q9BZW5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM6SF1Q9BZW5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TM6SF1Q9BZW5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM6SF1Q9BZW5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM6SF1Q9BZW5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM6SF1Q9BZW5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM6SF1Q9BZW5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM6SF1Q9BZW5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM6SF1Q9BZW5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM6SF1Q9BZW5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM6SF1Q9BZW5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM6SF1Q9BZW5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM6SF1Q9BZW5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM6SF1Q9BZW5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM6SF1Q9BZW5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM6SF1Q9BZW5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM6SF1Q9BZW5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM6SF1Q9BZW5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM6SF1Q9BZW5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM6SF1Q9BZW5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM6SF1Q9BZW5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM6SF1Q9BZW5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM6SF1Q9BZW5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms