Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
BCO2Q9BYV7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCO2Q9BYV7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms