Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL25A1Q9BXS0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL25A1Q9BXS0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms