Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKNK1Q9BUB5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKNK1Q9BUB5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms